Le Professeur Jean-Luc Migué a publié de nombreux ouvrages, en français et en anglais, dont :
- Santé publique, santé en danger, éditions de l’Institut Charles Coquelin, décembre 2005;
- Le monopole de la santé au banc des accusés, Varia, 2001 ;
- Étatisme et déclin du Québec, Varia et Institut économique de Montréal 1999 ;
- Le choix en éducation : levier de qualité et d’efficacité!, 2 t., ENAP/Sainte-Catherine, Collège Charles-Lemoyne, 2 t., Québec, 1996 ;
- Une société sclérosée — quand le mal européen gagne le Canada (l’Étincelle, Montréal, 1994) ;
- Cet ouvrage, aussi publié en portugais, lui a valu en 1994 la Médaille d’Argent du Sir Antony Fisher Memorial Award. James Buchanan, père de la théorie des Choix Publics et « Prix Nobel » d’économie, faisait partie du jury ;
- Le monopole public de l’éducation : l’économie politique de la médiocrité, avec Richard Marceau, Sillery, Presses de l’Université du Québec, 1989 ;
- L’économiste et la chose publique, Montréal, Presses de l’Université du Québec/Toronto, Institut d’administration publique du Canada, 1979 ;
- Le prix du transport au Québec, avec Gérard Bélanger et Michel Boucher, Québec, Éditeur officiel/Ministère des transports, 1978 ;
- Le prix de la santé, avec Gérard Bélanger, Montréal, Hurtubise HMH, 1972. Aussi publié en anglais ;
- Le Québec d’aujourd’hui : regards d’universitaires, Montréal, HMH Hurtubise, 1971.
Il a de plus publié de nombreux articles dans des revues canadiennes et internationales, dont: